Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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