Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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TUBB3Q13509 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TUBB3Q13509 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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TUBB3Q13509 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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TUBB3Q13509 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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TUBB3Q13509 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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TUBB3Q13509 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TUBB3Q13509 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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