Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MKRN4PQ13434 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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