Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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