Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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