Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTP4A2Q12974 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTP4A2Q12974 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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