Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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