Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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HOXC5Q00444 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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HOXC5Q00444 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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HOXC5Q00444 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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HOXC5Q00444 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HOXC5Q00444 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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