Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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USP18Q9UMW8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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USP18Q9UMW8 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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USP18Q9UMW8 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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USP18Q9UMW8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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