Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MEIS3Q99687 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MEIS3Q99687 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms