Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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