Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
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ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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