Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CDO1Q16878 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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