Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPROQ16827 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPROQ16827 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPROQ16827 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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