Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NPTX1Q15818 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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