Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF1Q15637 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF1Q15637 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF1Q15637 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF1Q15637 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF1Q15637 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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