Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms