Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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CHD4Q14839 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHD4Q14839 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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