Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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NEDD9Q14511 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD9Q14511 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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NEDD9Q14511 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NEDD9Q14511 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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