Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CKAP5Q14008 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms