Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCINQ13939 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCINQ13939 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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