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| FHL3 | Q13643 | RASSF8-210 | ENST00000541490 | 5505 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | OR51A4-202 | ENST00000641898 | 4393 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | RGPD6-201 | ENST00000329516 | 7165 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | NEDD4-208 | ENST00000508342 | 7235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | CYLC2-202 | ENST00000487798 | 2053 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.7-201 | ENST00000362352 | 102 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.121-201 | ENST00000363309 | 113 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
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| FHL3 | Q13643 | SNORD114-6-201 | ENST00000364393 | 72 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1325P-201 | ENST00000364905 | 105 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.456-201 | ENST00000384232 | 111 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL355796.1-201 | ENST00000406706 | 323 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL592431.2-201 | ENST00000422198 | 171 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC105272.1-201 | ENST00000438604 | 198 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | RPS27P22-201 | ENST00000478056 | 241 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | RN7SL633P-201 | ENST00000488974 | 297 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC021491.3-201 | ENST00000513378 | 156 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| FHL3 | Q13643 | SCGB1D5P-201 | ENST00000515134 | 247 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |