Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SF3B2Q13435 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SF3B2Q13435 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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SF3B2Q13435 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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