Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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