Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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