Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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