Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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SMARCB1Q12824 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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SMARCB1Q12824 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SMARCB1Q12824 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SMARCB1Q12824 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SMARCB1Q12824 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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