Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRHP20396 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRHP20396 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRHP20396 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRHP20396 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRHP20396 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRHP20396 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRHP20396 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRHP20396 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRHP20396 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRHP20396 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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