Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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