Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COPS7AQ9UBW8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COPS7AQ9UBW8 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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