Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q9NZC3 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q9NZC3 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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