Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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