Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXD1Q16676 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXD1Q16676 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms