Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SEC23BQ15437 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SEC23BQ15437 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SEC23BQ15437 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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SEC23BQ15437 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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