Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE3CQ15386 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
UBE3CQ15386 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms