Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
NR1I3Q14994 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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