Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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