Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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VGLL4Q14135 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
VGLL4Q14135 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VGLL4Q14135 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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