Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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SCARB2Q14108 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SCARB2Q14108 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SCARB2Q14108 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SCARB2Q14108 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SCARB2Q14108 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SCARB2Q14108 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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