Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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