Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TMED1Q13445 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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TMED1Q13445 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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TMED1Q13445 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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TMED1Q13445 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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TMED1Q13445 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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TMED1Q13445 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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TMED1Q13445 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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TMED1Q13445 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TMED1Q13445 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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