Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NME3Q13232 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms