Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3BQ13214 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3BQ13214 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms