Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RESTQ13127 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RESTQ13127 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RESTQ13127 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RESTQ13127 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RESTQ13127 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.6 ms