Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DUSP4Q13115 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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