Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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TRAF1Q13077 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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TRAF1Q13077 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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TRAF1Q13077 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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TRAF1Q13077 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF1Q13077 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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TRAF1Q13077 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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