Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
NFIAQ12857 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms