Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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RAB40BQ12829 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB40BQ12829 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB40BQ12829 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB40BQ12829 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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RAB40BQ12829 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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RAB40BQ12829 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB40BQ12829 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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RAB40BQ12829 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB40BQ12829 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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RAB40BQ12829 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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RAB40BQ12829 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB40BQ12829 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB40BQ12829 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB40BQ12829 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB40BQ12829 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB40BQ12829 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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