Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
EFEMP1Q12805 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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