Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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HOXC5Q00444 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HOXC5Q00444 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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